La Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales es una entidad científica, sin ánimo de lucro, con personería jurídica y patrimonio propio. 

Su constitución es la siguiente: 

La administración de la Academia está en manos de una Junta Directiva elegida cada dos años individualmente por los miembros con derecho a voto, cada dos años. Sus integrantes pueden ser reelegidos. 

La Academia puede establecer Academias o Centros Regionales de Investigación Científica en otras ciudades del país. 

La Academia es Correspondiente de la Real Academia de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales de Madrid, mantiene vínculos estrechos con la Academia de Ciencias para el Mundo en Desarrollo (TWAS), es miembro del Consejo Internacional de Uniones Científicas (ICSU), la Unión Internacional de Historia y Filosofía de la Ciencia (IUHPS) y su División de Historia de la Ciencia (DHS) y es promotora de la Federación Latinoamericana de Academias de Ciencias, la Comunidad Científica del Caribe, la Academia de Ciencias del Caribe y la Academia de Ciencias de América Latina. 

La Academia Colombiana de Ciencias tiene por objeto la investigación científica y su fomento en los campos de las ciencias exactas, físicas y naturales, a la vez que la cooperación en el mejoramiento de la docencia de estas ramas del conocimiento en los distintos niveles de la enseñanza. 

También es deber de la Academia colaborar con las correspondientes entidades nacionales e internacionales en la adecuada conservación y defensa del patrimonio científico de Colombia, en especial de los elementos ambientales y recursos naturales. 

En virtud de lo dispuesto por la Ley 34 de 1933 y en el Decreto Ejecutivo 1218 de 1936, la Academia es Cuerpo Consultivo del Gobierno Nacional, y como tal atiende las consultas y solicitudes de carácter científico que le hagan los distintos órganos del poder público. Para este fin, nombra comisiones ad hoc integradas por miembros, numerarios o no, de la corporación. 

Las consultas presentadas por entidades no gubernamentales serán remuneradas de acuerdo con lo que se establezca en el contrato que celebren la Academia y la entidad interesada. 

Con el fin de dar cabal cumplimiento a su finalidades la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales ha constituido además las siguientes Comisiones Permanentes.